L'istituto femminile Seika (清華院女学校 Seika-in jogakkō?) protegge l'innocenza delle sue studentesse nobili tagliandole fuori dal resto del mondo. Questo completo isolamento, però, rende incapace un gran numero di diplomate di far fronte alla realtà esterna, ragion per cui, come soluzione, la scuola rapisce un maschio qualsiasi — che capita di essere Kimito Kagurazaka — nella speranza che la sua influenza riesca a preparare meglio le proprie alunne all'impatto con la vita degli adulti. Sfortunatamente per lui, Kimito è stato considerato infatti un candidato adatto a questo progetto solo perché è stato scambiato per un omosessuale con un fetish per i muscoli, non rappresentante quindi un pericolo per la castità delle ragazze. Di conseguenza Kimito, intimorito dalla minaccia di essere castrato nel caso in cui tutto ciò non si fosse rivelato vero, accetta di collaborare, incontrando, poco dopo la sua iscrizione, Aika Tenkūbashi, ossia una studentessa alternativamente timida, testarda e/o pretenziosa che è anche innocentemente affascinata dal mondo esterno.

La storia parla di Ichijou e Kirisaki. Le loro famiglie (precisamente lui Yakuza, lei Gangsters) sono in guerra per il controllo del business, ma i due leader vorrebbero andare d'accordo poiché se la guerra non si ferma ci saranno molte vittime. Per questo motivo i due leader decidono che i loro rispettivi nipoti, Ichijou e Kirisaki, dovranno diventare amanti e sposarsi, in modo che le loro famiglie vadano d'accordo l'una con l'altra. I due ragazzi diventeranno amanti ufficiali e le loro famiglie andranno d'accordo? O continueranno a lottare e creare molti problemi?

Dopo aver perso sua sorella minore in un incidente, Toru Kokonoe decide di voler diventare più forte e per questo motivo si iscrive all'accademia Kōryō (昊陵学園 Kōryō gakuen?), una scuola speciale dove gli studenti manifestano le proprie anime sotto forma di armi chiamate Blaze. Anche Toru è in grado di generare la sua Blaze, ma per qualche ragione essa prende forma di uno scudo e non di un'arma.

Oozora Haruka, che si è appena trasferita a Okinawa, è generalmente allegra e ottimista, ma c'è una cosa di cui si sente insicura: è più alta della maggior parte delle altre ragazze. Anche sua cugina Higa Kanata ha un problema: ha dovuto lasciare il suo beach volley perché era troppo bassa. I cugini spaiati si ritrovano a formare una squadra di beach volley.

Lux, un ex principe di un impero chiamato Arcadia che è stato rovesciato da una ribellione cinque anni prima, sconfina accidentalmente nella zona dei bagni di un dormitorio femminile, vede la nuova principessa del regno Lisesharte nuda, incorrendo nella sua ira. Lisesharte sfida poi Lux a un duello Drag-Ride. I Drag-Rides sono antiche armi meccaniche corazzate che sono state scavate nelle rovine di tutto il mondo. Lux era chiamato il Drag-Knight più forte, ma ora è conosciuto come il Drag-Knight "imbattuto più debole" perché non attaccherà assolutamente in battaglia. Dopo il suo duello con Lisesharte, Lux finisce per frequentare l'accademia per sole donne che addestra i reali ad essere Drag-Knights.

Fuutarou Uesugi è uno studente povero e asociale che un giorno incontra il ricco studente trasferito Itsuki Nakano. Litigano ma quando Uesugi si rende conto di essere il suo tutore, cerca di mettersi in condizioni migliori. Nel tentativo di farlo incontra altre quattro ragazze.

Kobayashi vive da solo in un appartamento, finché un giorno, Tooru è apparso e hanno finito per vivere insieme. Tooru considera gli umani inferiori e sciocchi, ma essendo stata salvata da Kobayashi-san, fa tutto il possibile per ripagare il debito e aiutarla in varie cose, anche se non tutto va secondo i piani.

Odiato da tutti quelli che lo circondano, Sei Handa continua la sua vita al liceo considerato come un emarginato, o almeno questo è ciò che crede. In realtà, Sei è lo studente più popolare del campus, venerato da tutti per le sue incomparabili capacità di calligrafia, bell'aspetto e personalità cool. Tuttavia, a causa di una serie infinita di incomprensioni, Handa percepisce l'adorazione che riceve dalle sue legioni di fan come prepotenza, portando l'idolo della scuola a isolarsi dal resto dei suoi compagni di classe. Ma prendere le distanze dai suoi coetanei non impedisce loro di adorarlo; infatti, i suoi tentativi di distogliere l'attenzione da se stesso finiscono spesso per convertire involontariamente in credenti anche il più scettico degli studenti. Modelli di moda, delinquenti reclusi, fangirl ossessive e altro ancora: nessuno può resistere allo splendore che è Sei Handa.

Ichiro Suzuki è un programmatore ventinovenne di giochi a cui è stato assegnato il compito di correggere diversi bug in due MMORPG che la sua azienda sta preparando per la pubblicazione, diventando estremamente stanco mentre lavora anche durante il fine settimana. Dopo aver fatto un pisolino, si risveglia misteriosamente in un mondo parallelo, che ricorda alcuni dei mondi fantasy RPG su cui aveva lavorato, come un quindicenne di nome Satō Pendragon, un soprannome che usava durante i beta test, e con quella che sembra essere la schermata del menu del gioco a cui stava lavorando. Tuttavia, prima che riesca a capire la sua situazione attuale, un esercito di Lizardmen gli tende un'imboscata, e nella disperazione usa tutte e tre le sue speciali opzioni di attacco "Pioggia di meteore" (una soluzione rapida che aveva aggiunto al gioco per i nuovi giocatori che uccide tutti i nemici nelle vicinanze) e li cancella tutti; oltre a loro elimina inavvertitamente anche una divinità (viene in seguito rivelato che si tratta del Dio Drago Akon Kagura). Di conseguenza, il suo livello passa da 1 a 310, massimizzando immensamente le sue statistiche. Non avendo modo di tornare nel suo mondo, Satō si propone di scoprire i segreti di questo nuovo come un avventuriero di alto livello armato di una miriade di diverse abilità e armi fisiche, cognitive e magiche, iniziando a guadagnarsi la fiducia e l'affetto di molte persone e cercando di nascondere le sue potenti statistiche.

Il nostro MC scopre che la sua scuola gli richiede di entrare in un club e durante la sua riluttante ricerca si imbatte in Tejina-senpai, che tenta trucchi magici nella sua stanza del club. Tejina-senpai ha comunque una grande paura del palcoscenico e quindi ora che ha un pubblico i suoi tentativi sono semplicemente comici.

Yamada è una graziosa quindicenne ossessionata dal sesso la quale, appena entrata alle scuole superiori, si è posta come obiettivo massimo a cui aspirare quello di avere rapporti sessuali con almeno cento differenti ragazzi (i suoi futuri sex friend come li chiama). Tuttavia Yamada si trova ad esser ancora piuttosto insicura, timida ed oltretutto vergine, il che si pone chiaramente come un ostacolo per il felice adempimento del proprio obbiettivo (ciò la porta a scappar da qualsiasi ragazzo che tenti d'approcciarla per la strada).

Ganta è l'unico sopravvissuto dopo che un misterioso uomo vestito di rosso ha massacrato un'aula piena di adolescenti. Viene incastrato per la carneficina, condannato a morte e rinchiuso nella prigione più contorta mai costruita: Deadman Wonderland. E poi peggiora.

La dark fantasy segue un secondo anno di scuola superiore di nome Akihito Kanbara. Sebbene il ragazzo sembri umano, è per metà Youmu e invulnerabile alle ferite perché può guarire rapidamente. Un giorno, Akihito incontra la matricola Mirai Kuriyama quando sembra che stia per saltare dal tetto della scuola. Mirai è isolata a causa della sua capacità di manipolare il sangue, che è considerata un'eresia tra i membri del mondo degli spiriti. Eventi inquietanti iniziano a svolgersi dopo che Akihito salva Mirai.

La storia della "home comedy nel mondo alternativo", ha come protagonista l'hikikomori e otaku di anime, manga e videogames, Kazuma Satou che un giorno, nel tentativo di salvare una ragazza, è vittima di un incidente stradale. Giunto nell'aldilà incontra una ragazza di nome Aqua che gli si presenta come la dea addetta a coloro che vi giungono dopo la morte. Oltre ad andare in paradiso o a reincarnarsi, la dea propone una soluzione alternativa a Kazuma: essere inviato in un mondo fantasy per sconfiggere il Re dei Demoni che in quella dimensione sta affliggendo la popolazione e minando l'equilibrio delle reincarnazioni. Dopo aver canzonato Kazuma per le circostanze della sua morte gli fa un ulteriore concessione: "Scegli una qualsiasi abilità o una qualsiasi cosa a tuo piacimento e potrai portarla con te per adempiere alla tua missione", ma Kazuma la spiazza dicendo "...Allora, scelgo te.".

Quando il giovane studente Sora Kashiwagi si vede recapitare un enorme pacco inviatogli dal padre "avventuriero", l'ultima cosa che il ragazzo si aspetta è di trovarsi davanti ad una grande bara... dalla quale salta fuori una mummia tanto piccola e carina da stare comodamente nel palmo della sua mano!

Tokyo è in fermento con i persocom, computer umanoidi virtualmente perfetti. Hideki, socialmente e tecnologicamente inetto, non vede l'ora di metterne le mani sopra. Quando trova Chii abbandonata nella spazzatura, è più carina di qualsiasi modello attuale che abbia mai visto prima. Ma quando lui la porta a casa e la accende, lei non ha dati e solo un singolo programma di apprendimento installato. Mentre Hideki mette tutto il suo cuore nell'insegnare a Chii i dettagli dell'umanità, un mistero si svela mentre un oscuro segreto si risveglia.

Per Hikari Tsutsui, la vita nel regno bidimensionale è molto più semplice. Socialmente inetto e goffo, si immerge nei videogiochi e negli anime, solo per essere inesorabilmente ridicolizzato e ostracizzato dai suoi compagni di classe. A condividere la sua sofferenza c'è Yuuto Itou, il suo unico amico, che indossa le orecchie da gatto ed è ugualmente ossessionato dal mondo dei giochi. Dopo essere stato costretto a pulire la piscina come punizione per essere arrivato in ritardo, Tsutsui incontra Iroha Igarashi, ma tenta di evitarla, poiché la sua notorietà la precede. Sfacciatamente schietto, odiato dalle compagne di classe e famigerato per aver scherzato con i ragazzi, Tsutsui crede che essere coinvolto con lei non causerebbe altro che problemi. 3D Kanojo: Real Girl è una storia che ruota attorno a questi due emarginati: un ragazzo pieno di emozioni che non ha mai provato prima, che lotta per metterle a nudo e una ragazza che si sforza di farlo uscire dal suo guscio.

Dopo essere stato trasportato in un altro mondo, nel regno magico di Klyrode, come candidato futuro eroe, Banaza si ritrova squalificato dal ruolo in quanto dotato solamente delle abilità di comune cittadino. Inoltre a causa di un errore del regno magico, invece di essere rimandato nel suo mondo si trova intrappolato a Klyrode. Con il raggiungimento del Livello 2, Banaza acquisisce capacità e magia fino a diventare un super cheat e superare ogni limite, ma sempre con il sorriso sulle labbra e con semplicità!

Le abilità di elettro-manipolazione di Misaka - e la mossa del proiettile Railgun deliziosamente distruttiva - la rendono una rock star ad Academy City. La tecno-metropoli è piena di studenti con poteri soprannaturali noti come espers, tra cui Kuroko, l'amica civettuola e coinquilina di Misaka. Usa le sue capacità di teletrasporto come membro del team delle forze dell'ordine di Judgment, combattendo il crimine insieme al suo collega agente Uiharu. Insieme al loro amico Saten, un coraggioso esper di livello 0, Misaka, Kuroko e Uiharu si divertono tantissimo ad affrontare il pericolo ogni volta e ovunque si presenti.

Juliet Percia e Romeo Inudzuka sono a capo di due dormitori rivali in cui risiedono gli studenti appartenenti a due paesi differenti. Le due fazioni sono in guerra tra loro per contendersi il controllo dell'isola in cui vivono. Inudzuka e Percia si dimostrano agli occhi dei loro compagni di dormitorio come acerrimi nemici, ma in realtà sono segretamente innamorati l'uno dell'altra e costretti a mantenere nascosta la loro relazione per non subire ripercussioni.