Hatsunejima abbonda di misteri, uno dei quali sono i ciliegi immortali della città che si dice esaudiscano i desideri più genuini. Ci sono anche voci su persone che possiedono poteri soprannaturali, come Junichi Asakura, che può vedere i sogni degli altri e creare dolci dal nulla. Insieme a sua sorella Nemu, gli piace vivere in pace con i suoi amici all'Accademia Kazami, ma sceglie di nascondere la sua identità nel segreto. La sua tranquilla vita scolastica si interrompe quando scopre che la sua amica d'infanzia Sakura Yoshino è tornata dall'America dopo sei anni. È lì per uno scopo: mantenere le promesse che ha fatto molto tempo fa con Junichi. Nessuno sa, tuttavia, che l'aspetto di Sakura è destinato a cambiare la vita di tutti, in meglio o in peggio.

Racconta la storia della vita scolastica di Mafuyu Oribe e Tomo Yamanobe alla scuola ortodossa orientale St. Mihailov Academy all'interno della quale subiscono persecuzioni e ostracismo da parte della figlia dell'attuale preside Miyuri Tsujidou e il suo secondo in comando Hana Katsuragi. La vita di Mafuyu e Tomo prende una drastica svolta quando un giorno percorrendo la strada di casa incontrano un ragazzo svenuto e ferito dai capelli d'argento di origini russe Aleksander Hell "Sasha" Nikolaevič. Quasi immediatamente, Sasha inizia a ripagare Mafuyu e Tomo respingendo coloro che volevano ucciderle. Suo malgrado Sasha è Qwaser e grazie a ciò riesce a fronteggiare gli Adepti che non si fanno scrupolo degli esseri umani presenti riducendo l'accademia in una zona di guerriglia, al fine di acquisire la Theotokos di Tsarytsin da Athos, che mantiene l'icona.

Hino Kahoko frequenta la sezione regolare di una scuola che per metà è un conservatorio. Le piace la musica ma non ha mai provato a suonare alcun strumento, fino al giorno in cui incontra Lili, un folletto della musica che si dice essere il protettore della scuola fin dalla sua creazione. Solo pochi esseri umani riescono a vederlo e a questi fortunati fa il dono di poter esprimere i sentimenti attraverso il suono di uno strumento, anche a quelle persone come Kahoko che di musica ne capiscono poco o niente. La ragazza è incredula, ma ben presto si renderà conto che il folletto è serio nelle sue intenzioni, si troverà infatti iscritta a sua insaputa al concorso musicale che la scuola organizza ogni anno, riservato solitamente agli allievi più meritevoli della sezione musicale. A nulla varranno le sue richieste di non partecipare, perché il preside stesso conosce Lili e appoggia le sue scelte.