Atari Kobayashi è una guardia di dodici anni che vive a Megasaki City, città giapponese di cui è sindaco Kobayashi. Quando, con un decreto esecutivo, tutti i cani domestici vengono esiliati in un'enorme isola adibita ai rifiuti, Atari si allontana da solo alla ricerca del suo cane Spot. Con l'aiuto di nuovi amici, inizierà un epico viaggio che deciderà il destino e il futuro dell'intera Prefettura.

Ken Kaneki, trasformato in ghoul in seguito a un misterioso incidente, si è unito all'Anteiku, un bar che raccoglie alcuni ghoul che cercano un rapporto meno predatorio col mondo umano. Ma il caos tornerà a inseguirlo attraverso l'interesse di Shuu Tsukiyama, un potente ghoul noto come Gourmet, ossessionato alla ricerca di nuovi sapori e quindi interessato a divorare Kaneki. Il film è il sequel di Tokyo Ghoul, un film del 2017, che a sua volta è basato sulla serie manga Tokyo Ghoul, da cui hanno tratto anche un anime.