Eureka è una città segreta abitata dalle migliori menti degli Stati Uniti. Mentre sta riportando a Los Angeles Zoe, una fuggitiva che si rivelerà essere la figlia ribelle, l'agente Jack Carter si ritrova bloccato nella città a causa di un guasto all'auto. Lo sceriffo del luogo subisce un incidente, e Jack prende il suo posto. I

16 ottobre 1989: una catastrofica pioggia di meteoriti contenenti un minerale radioattivo, la kryptonite, si abbatte sulla cittadina di Smallville, nel Kansas. Due coniugi, Jonathan e Martha Kent, trovano in un campo un bambino nei pressi di una astronave e decidono di prenderlo con sé e crescerlo come un figlio. Dieci anni più tardi Clark Kent, il bambino divenuto ormai un adolescente, e l'amica Chloe Sullivan, entrambi giornalisti in erba del liceo di Smallville, indagano su alcuni eventi inspiegabili che si verificano nella cittadina e che sono causati dai frammenti dei meteoriti ancora presenti, che hanno modificato geneticamente alcuni abitanti dotandoli di strani poteri.

Ambientato 51 anni prima degli eventi narrati in Battlestar Galactica (2003), questo prequel esplorerà le vite di due famiglie: i Graystone - tra i quali Daniel, il padre, genio dei computer, Amanda, la madre, un brillante chirurgo, e Zoe, la loro figlia - e gli Adama. Le due famiglie si ritrovano su posizioni opposte riguardo la decisione di creare i Cylon: robot intelligenti che un giorno si ribelleranno e quasi annienteranno la popolazione di Caprica.