L'anime narra di una ragazza che frequenta il terzo anno delle scuole superiori: la giovane ama costruire modellini in plastica, e per tale motivo frequenta uno strampalato club di modellismo.

Mai Taniyama è una studentessa della superiori il cui passatempo preferito è raccontare, insieme suoi amici, storie di fantasmi, finchè non incontra Kazuya Shibuya suo compagno di scuola e fondatore di un istituto di ricerca nel campo dei fenomeni paranormali: la Shibuya Psychic Research Center. I due si ritravano a dover collaborare per rislvere diversi casi legati al paranormale, finchè Mai non scopre di possedere ella stessa dei poteri.

Kirihara Aruto è un grande appassionato di Alice e delle storie a lei dedicate, tanto da scrivere lui stesso la sua propria versione di Alice. Una notte intravede dalla finestra, al chiaro di luna, una ragazza che a prima vista identifica proprio come la sua amata Alice e che decide di seguire. Improvvisamente si ritrova coinvolto in una battaglia tra due ragazze vestite in maniera bizzarra, che termina con la vittoria di quella intravista da Aruto, che subito si impossessa del libro nascosto nel cuore dell'avversaria. Il giorno successivo Aruto, ancora stordito dall'evento, viene avvicinato da Arisu Arisugawa che si rivela essere la misteriosa ragazza vista la sera prima e per di più una "cercatrice di Alice".

Vampiri, robot, stregoneria ... E questo è tutto prima della lezione di ginnastica! Benvenuti alla Mahora Academy, una scuola per sole ragazze in cui l'impossibile e l'incantevole fanno parte del curriculum. È l'inizio del nuovo anno scolastico e le emozioni dilagano quando le ragazze della Classe 2-A incontrano l'ultima aggiunta allo staff: Negi Springfield. Negi, un bambino prodigio di dieci anni, nato in Galles, ha più problemi che studenti. Come mago in formazione, questo incarico accademico è l'ultimo requisito nella sua ricerca per diventare un Magister Magorum. Ma se incasina le cose e le ragazze lo scoprono, l'esistenza come un ermellino esotico sarà il suo destino!