Squadra speciale Lipsia ruota attorno a quattro agenti, parte di una squadra speciale della polizia, che intervengono nelle situazioni più critiche e pericolose. Alla guida del nucleo operativo c'è il commissario capo Hajo Trautzschke, intelligente e caparbio, che ha perso la moglie in un incidente e vive in una villetta alla periferia di Lipsia con la figlia Leni. Jan Maybach, funzionario del Dipartimento Federale della Polizia Criminale di Colonia, è un profiler che si trasferisce a Lipsia dopo la separazione dalla moglie Anja con il figlio di nove anni Benni. Ina Zimmermann, fredda e determinata, si prende cura del fratello minore Tobias dopo la prematura morte dei genitori, mentre il commissario Miguel Alvarez, entrato in squadra per ultimo, ha scarsa esperienza e affronta i casi impulsivamente

L'intraprendente commissario Sophie Haas si trova a svolgere il proprio lavoro in un tranquillo paese di campagna nella zona dell'Eifel dopo essere stata trasferita dalla nativa Colonia.

Protagonista delle vicende sono una squadra di poliziotti e una squadra di medici legali di Berlino, rispettivamente capitanati dal Commissario Capo Mirko Kiefer e dalla Dott.ssa Katrin Stoll, che agiscono in perfetta sinergia nella soluzione di intricati casi di omicidio avvenuti alcuni decenni prima.

Il sedicenne Juri e suo padre si trasferiscono in un vecchio edificio prefabbricato. Il ragazzo si accorge presto che l'edificio ha una vita propria e si nutre del dolore dei residenti. Insieme agli altri inquilini, quindi, prova a combatterlo.