1387: Arnau Estanyol, ormai anziano, è amministratore del Piatto di Santa Maria del Mar e probiviro di Barcellona; la vita sembra aver finalmente concesso a lui e alla moglie un po’ di pace. Ma la morte di Re Pietro sconvolge gli equilibri della città: il Principe Giovanni sale al potere e, con lui, i Puig che non tardano ad attuare la loro sanguinosa vendetta. Nessuno osa contrapporvisi, tranne Hugo Llor un 12enne che ha trovato in Arnau un mentore. Questo ragazzo, che a poco a poco diventerà un uomo, ha un sogno: diventare costruttore di navi. Ma saranno proprio i Puig, a mettere in atto contro di lui una ritorsione covata da anni…

Il Ministero del Tempo è un'istituzione governativa segreta che dipende direttamente dal Capo del governo spagnolo. Solo i monarchi, i capi del governo e un numero ridotto ed esclusivo di persone conoscono la sua esistenza. Il passaggio tra le varie epoche si effettua attraversando delle porte sorvegliate dalle pattuglie del ministero. L'obiettivo è quello di scoprire e impedire che qualsiasi intruso del passato giunga al nostro presente — o viceversa — col fine di cambiare la Storia a suo vantaggio. Per realizzarlo, le pattuglie dovranno viaggiare nel passato interagendo con vari personaggi storici. All'interno del ministero lavorano molte persone appartenenti a epoche diverse. Il trio protagonista è formato da Julián Martínez (Sancho), Amelia Folch (Garrido) e Alonso de Entrerríos (Fresneda). Julian è un'infermiere del SAMUR che entra nel Ministero dopo aver perso sua moglie in un incidente stradale, che gli causa un grande dolore. La sua poca preoccupazione di rimanere in vita è la sua più grande qualità. Amelia è una donna del diciannovesimo secolo che diventa il cervello del gruppo grazie alla sua intelligenza, alla conoscenza della storia e della letteratura spagnola ed alla sua memoria fotografica. Infine, Alonso è un soldato siciliano del sedicesimo secolo, che ha alcuni vecchi valori, ma che è un perfetto stratega e fedele alla causa. Altri personaggi ricorrenti saranno Irene Larra (Cayetana Guillén Cuervo), una donna scettica degli anni '30; Ernesto Jiménez (Juan Gea), funzionario solitario; Salvador Martí (Jaime Blach), sottosegretario alle missioni speciali; e Lola Mendieta (Natalia Millán), una spia per i francesi durante la seconda guerra mondiale.

Dopo essere scomparsa in strane circostanze da bambina, Paula riappare come una bellissima ed enigmatica adolescente di 17 anni. Marcos, un ambizioso poliziotto, è il responsabile delle indagini, soprattutto perché la storia della ragazza è piena di incognite che le fanno dubitare della sua veridicità. La ragazza viene restituita ai suoi genitori, ma nessuno è abbastanza sicuro che sia davvero chi dice di essere.

Inés Suárez, l'unica donna spagnola che ha partecipato alla Conquista del Cile nel 1540, al fianco del suo amante il conquistatore Pedro de Valdivia. Inés è una guerriera che lotta e che riuscirà ad ottenere tutto quello che vuole, potere, terre e amore.

Alba si sveglia su una spiaggia dopo uno stupro che non ricorda. E poi scopre che i suoi stupratori sono amici del suo amante.