Un giorno di ottobre, improvvisamente, il 2% della popolazione mondiale (140 milioni di persone) scompare in un solo istante. Alcuni si convincono che la Terra sia stata colpita dal "Rapimento della Chiesa", altri rifiutano di vederlo come un evento mistico, e nessuno, in realtà, sa veramente cosa sia accaduto. La serie ha inizio tre anni dopo l'evento, e segue le vicende della comunità di Mapleton, dove sono scomparsi nel nulla oltre cento abitanti.

Toby Logan è un paramedico altamente qualificato con un segreto: può leggere la mente. Toby non ha mai conosciuto veramente i suoi genitori ed è cresciuto in affidamento, questo insieme al suo segreto, che non condivide con nessuno, lo ha reso un po' un solitario. Fino ad ora, Toby ha tenuto nascosta la sua abilità, esplorando le sue possibilità solo con il suo mentore e confidente di lunga data, il dottor Ray Mercer.