In un prossimo futuro due multinazionali sono impegnate nella ricerca della più potente delle armi: La Doji Heavy Industry orientata nel campo delle armi convenzionali e la NSWF specializzata invece nella manipolazione genetica per la ricerca dell'essere umano superiore. Ciò che vogliono è la "WitchBlade" che può essere indossata solo da una donna particolare con il potere di controllarla. Sei anni dopo il terremoto che ha raso al suolo la città di Tokyo, Amaha Masane e la sua bambina Naoko si stabiliscono nella città ancora semidistrutta. Stanno fuggendo dall'Asylum, l'ente incaricato della salvaguardia dei pochi bambini nati dopo la catastrofe, e il loro unico desiderio è di continuare a vivere insieme come una famiglia. Ma ciò che le aspetta è un fato crudele asservito agli oscuri poteri della Witchblade.

Un urlo nella notte, e in quell'istante il mondo è cambiato ... o almeno, sembrava. La storia si sviluppa attorno a una creatura chiamata Boogiepop. Boogiepop, chiamato anche "morte", frequenta la città e ogni volta che lo incontri ti porterà con sé. Nagi Kirima, una studentessa delle superiori, sembra combattere contro Boogiepop - o almeno, ci prova. Ma poi ci sono sparizioni ovunque e accadono strani avvenimenti. E nessuno vede il collegamento tra di loro. In un misto di caos e orrore elettrizzante, Nagi cerca di scoprire cosa è successo ... e perché non gli è ancora successo

Nel 2075, per l'umanità i viaggi nello spazio non sono più un sogno, ma una realtà di tutti i giorni. I progressi tecnologici e scientifici hanno portato alla colonizzazione della Luna e alla formazione di grandi corporazioni spaziali. Ai Tanabe, una ragazza dal carattere solare e ottimista, interessata a tutto ciò che riguarda il cosmo, si unisce alla Technora Corporation come membro della Sezione Detriti, un reparto dedicato alla rimozione dei pericolosi "rifiuti spaziali" vaganti tra le orbite terrestri e lunari. Tuttavia scoprirà presto che il suo lavoro è sottovalutato, e che la Sezione Detriti, scarsamente equipaggiata, e mal finanziata, è vista come lo zimbello della Technora. Ai non si lascia scoraggiare e prosegue sulla sua strada, facendo conoscenza con i suoi strambi colleghi di lavoro, tra i quali, il maldestro ma bonario direttore Philippe Myers, la misteriosa e riservata Edelgard Rivera, ma soprattutto Hachirota Hoshino, una testa calda che ambisce a possedere una navicella spaziale che porti il suo nome.