In una Terra ormai sull'orlo del collasso ecologico a causa dell'eccessivo inquinamento, un alieno del pianeta Selectol dà inizio al suo piano di conquista del pianeta, aiutato dalla sua organizzazione criminale Galactor e dal fidato luogotenente Berg Katse. A contrapporsi a questo dittatore galattico, noto semplicemente come Leader X, c'è un gruppo di cinque combattenti dotato di superpoteri: Ken l'aquila, Joe il condor, Pretty Jun il cigno, Ryu il gufo e Jinpei la rondine, meglio conosciuti come i Gatchaman.

L'opera racconta la storia di Yaeko Mitamura (detta Yakko; nella versione italiana Luciana, detta Licia), una ragazzina che lavora al Mambo, l'okonomiyaki-ya (ristorantino tipico specializzato in okonomiyaki) gestito dal padre Shige-san (Marrabbio). Un giorno Yakko vede per caso Hashizō (Andrea), un bambino che frequenta l'asilo, scappato di casa col suo gatto Giuliano, e si prende cura di loro. Poco dopo, mentre cammina per strada, si scontra con Gō (Mirko) il fratello maggiore di Hashizō, nonché leader e cantante del gruppo dei Bee Hive, preoccupato per la scomparsa del fratellino. Dopo un primo momento d'attrito, tra i due nasce un'amicizia destinata a tramutarsi in un travolgente amore.

La storia si svolge in Sudamerica all'epoca dei conquistadores spagnoli, che vagavano per il Nuovo Mondo alla ricerca dei tesori dei nativi americani. I protagonisti sono Estéban, un ragazzo spagnolo che si è recato nell'America del Sud in cerca di avventure e la sua amica Lia, ragazza appartenente ad una tribù inca che lo aiuterà a trovare la misteriosa città di Eldorado.

Sakimori Kagami gioca a un VRMMORPG (Virtual Reality Massively Multiplayer Online) chiamato Arch Earth Online. È un giocatore esperto e il suo avatar è quello di un famoso mago. Un giorno, avendo giocato per troppo tempo, crolla dal sonno, e, al suo risveglio, si trova nel mondo del gioco, ma non nel corpo del vecchio saggio Dunbalf, che aveva sempre usato come avatar, piuttosto in quello di una giovane e innocente ragazzina.